BIOEPAR développe des modèles de simulation qui prévoient la propagation des agents pathogènes à différentes échelles (lot d'animaux, troupeau, région, filière de production), ainsi que la dynamique de population de leurs vecteurs le cas échéant. Ces modèles permettent d'évaluer des stratégies de maîtrise ex-ante. Certains tiennent compte du processus de prise de décision par les gestionnaires (éleveurs, groupements, décideurs publics). 

Plus particulièrement, nous développons des modèles mécanistes, souvent stochastiques, appliqués à diverses maladies animales ou vecteurs, et qui peuvent être organisés comme suit.

 * Modèles à l'échelle régionale / filière

            - entre troupeaux bovins laitiers : BVD32, FQ30, PTB2,3

            - mouvements de jeunes bovins et BRD

            - entre troupeaux bovins (tout type) : BVD, FCO9

            - entre troupeaux porcins : portage de Salmonnelles17,25

            - multi-hôtes : FCO10, FVR7, PPA

            - autre : Vibrio aestuarianus dans une population d’huîtres spatialisée

            - visualisation de données : Transmissio

* Modèles à l'échelle troupeau

            - troupeau bovin laitier : BVDx, FQ11 à 13, PTB4,6,27 à 29, sélection génétique

            - troupeau bovin allaitant : BVD14

            - troupeau porcin : SDRP, portage de Salmonelles26

            - autre : pestivirus dans une population d'isards1,23

* Modèles à l'échelle lot

            - lot de jeunes bovins : BRD

            - aquarium : Vibrio aestuarianus dans une population d’huîtres en aquarium24

* Modèles à l'échelle intra-hôte

            - réponse immunitaire individuelle à l'infection par le virus du SDRP18

* Modèles de décision

            - décision individuelle : couplage modèles épidémiologique et économique, décision de vaccination

            - décision collective : gestion du SDRP35

* Modèles de dynamique de population de vecteurs

            - Moustiques5,15,33

            - Tsétsé8

            - Tiques19 et maladies transmises : babésiose bovine20 et CCHF21,22

 [Abréviations des maladies : BRD = maladie respiratoire des bovins, BVD = diarrhée virale bovine, CCHF = fièvre hémorragique de Crimée-Congo, FCO = fièvre catarrhale ovine, FQ = fièvre Q, FVR = fièvre de la vallée du Rift, PPA = peste porcine africaine, PTB = paratuberculose, SDRP = syndrome dysgénésique respiratoire porcin]

 Certains modèles ont donné lieu au développement d'outils d'aide à la décision pour les gestionnaires de la santé : MihmesTools16. Certains modèles ont été développés en mobilisant le logiciel EMULSION31.

 

Pour tout intérêt pour l'un ou l'autre de ces modèles, n'hésitez pas à contacter Pauline Ezanno

 

Références

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